Entre des parents complètement dingues et une école qui tient plus de la prison que du centre d'éveil, Matilda, une petite fille très très éveillée pour son âge, n'a pas vraiment beaucoup de chance. Mais Miss Honey, sa maîtresse, comprenant qu'elle a affaire à une enfant extraordinaire, décide de l'aider à s'épanouir.