Un sujet tabou :

Food, Inc. a représenté un véritable challenge pour son réalisateur. En effet, lors de ses investigations, Robert Kenner s'est vu refuser l'accès à de nombreuses industries de l'agro-alimentaire. Sa productrice Elise Pearlstein avoue même "qu'il aurait été plus simple de pénétrer dans le Pentagone que d'entrer dans une compagnie qui fait des céréales de petits-déjeuners." Face à ce tabou de la part des principaux protagonistes nationaux, l'équipe du film a dû assurer ses arrières, notamment en se référant constamment au premier amendement de la constitution américaine lors de la progression du film.

Un tournage de longue haleine :

Le tournage d'un documentaire demande toujours du temps, notamment dû à l'investigation. Dans le cas de Robert Kenner et de son équipe, quelques obstacles ont freiné leur travail : "Depuis que Eric Schlosser et moi avons commencé à en parler, cela a pris six à sept ans. Mais le film en lui-même, c'est deux ans et demi de travail. Cela a pris plus de temps que nous le pensions car on nous a interdit d'entrer dans beaucoup d'endroits."