Gan et sa petite amie Aï forment un duo de justiciers masqués appelé les « Yatterman » qui lutte contre le crime dans la ville de Tokyoko. Leur plus grand ennemi est un groupe d'arnaqueurs qui rivalisent d'ingéniosité pour extorquer de l'argent à la population : les Doronbo. Emmené par la belle Doronjo, le trio maléfique tente maintenant de rassembler les quatre légendaires pierres-crânes, qui une fois réunies, leur permettront d’exaucer leurs rêves. Mais les Yatterman lutteront jusqu'au bout pour les empêcher de mettre leur plan à exécution !