Le film s'ouvre sur le suicide collectif de 54 lycéennes, qui se jettent joyeusement sous un train, en découvrant un site Internet intitulé Suicide Club. C'est le début d'une vague de suicides inexpliqués qui déferle sur l'ensemble du Japon. Les pistes se multiplient, les suicides continuent. Les forces de l'ordre sont dépassées. La découverte, sur les lieux du crime, de rouleaux composées de lambeaux de peau humaine cousus les uns aux autres sème la confusion : ces suicides sont-ils vraiment volontaires ou bien sont-ils provoqués à distance par une organisation criminelle ?